為加強海洋水質環境監測能力，“海洋站生態環境長期綜合觀測系統集成技術研究與示范”項目先后在我國三沙海洋站、小麥島海洋站、硇洲海洋站布設了海洋水質在線監測系統。該項目中，我中心提供水樣自動采集系統、營養鹽自動分析儀及BOD自動分析儀，負責儀器的后期運行維護工作。
2018年8月底，三沙海洋站遭遇臺風，本套系統與儀器設備均受到不同程度的損壞，三家單位緊急磋商，陸續恢復設備工作能力。2019年1月，國家海洋技術中心、山東省科學院儀器儀表研究所、河北科技大學的工作人員再次前往寧德市三沙海洋站對海洋生態在線監測系統進行更新維護。本次設備維護和軟件升級，解決了儀器設備存在的問題，提高了系統應對突發狀況的能力。目前三個海洋站水質在線監測系統均正常運行，實現了對三個海域水質狀況的實時監測。
本項目的實施，使得小麥島等3個海洋站在對潮位、溫鹽、風速風向等傳統水文氣象參數進行觀測的基礎上，同時具備了pH、BOD、溶解氧、葉綠素、濁度、海水五項營養鹽等多項水質參數的實時監測能力，為實現海洋站一站多能提供了示范運行作用。（近海室）
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